از نظر ساختمانی مولکول کامل HCG دارای دو زیر واحد آلفا و بتا می‌باشد، زنجیره آلفا ساختمان مشابهی با زنجیره آلفای سایر هورمون های گلیکوپروتئینی مانند LH ,FSH و TSH دارد. تفاوتهای موجود در زیر واحد بتاست که تفاوتهای بیولوژیکی و ایمونوشیمیائی این هورمون ها را سبب می‌گردد که این تفاوتهای ایمونوشیمیائی در تشخیص و اندازه گیری این هورمون ها حائز اهمیت فراوان هستند. روشهای اختصاصی سنجش این هورمون امکان تشخیص بارداری را ۸ تا ۱۱ روز پس از لقاح فراهم می سازد.
