هلیکوباکتر پیلوری یک باسیل میکرو آئروفیل گرم منفی مارپیچی شکل است. این باکتری با داشتن فلاژل های قطبی امکان حرکت فعال را به خود میدهد. همچنین امکان تشکیل کلونی در لایه عمقی موکوس پوشاننده سلول های اپی تلیال معدی را دارند. کلونی های تولید شده مواد آنتی ژنیک چون آنزیم اوره آز، توکسین و پلی ساکارید را ترشح میکنند. این آنزیم ها زمینه ساز التهاب در لایه های مخاطی لوله گوارش فرد میشود