یون های آمونیوم حاصل کاتابولیسم اسیدهای آمینه در بافت های مختلف از جمله سیستم عصبی و عضلات هستند. همچنین همواره مقداری یون آمنیوم توسط باکتری ها در روده تولید می شود.کبد یون های آمونیوم را طی واکنش های متوالی به اوره غیر سمی تبدیل می کند تا بعد از وارد شدن به گردش خون به کلیه ها رفته و از طریق ادرار دفع شود
