HDL وظیفه برداشتن کلسترول از بافت ها را برعهده دارد. HDLبالا بر خلافLDL عمل حفاظت و پیشگیری را از طریق برداشتن کلسترول از بافت ها بر عهده داشته و در واقع بالا بودن HDL سبب کاهش خطر ابتلا به بیماری های کرونر قلبی و عروقی می شود، در صورتی که پایین بودن سطح HDL حتی درصورت نرمال بودن کلسترول سبب افزایش خطر ابتلا به بیماری های ذکر شده می گردد.